В ранней стадии разработки лекарств традиционные методы дают лишь 5% успешных попаданий, а первичный скрининг занимает более полугода. Исследователи вынуждены работать с данными, разбросанными по PubMed, внутренним лабораторным заметкам и базам генома. Критическая информация оказывается изолированной, что замедляет поиск новых соединений и увеличивает риск дублирования работы. При уходе сотрудников теряется неявное знание, что подрывает преемственность исследований.

AWS предложила подход, основанный на технологии Bring Your Own Knowledge Graph (BYOKG) и GraphRAG — графовой дополненной генерации. Решение использует Amazon Neptune Analytics для высокопроизводительной обработки графа и Amazon Bedrock для генерации ответов на естественном языке. Исследователь может задать сложный вопрос, и система выдаст ответ, основанный на данных из единого графа знаний, который связывает соединения, гены, белки и клинические исследования. При этом каждое утверждение сопровождается цепочкой цитирования — от исходной публикации до конкретного шага обхода графа.

ПроблемаОписание
Низкая успешность5% попаданий, более 6 месяцев скрининга на попытку
Фрагментированные системы знанийДанные разбросаны по PubMed, лабораторным запискам и базам генома
Потеря институциональной памятиПри уходе исследователей теряется неявное знание

Ключевое отличие GraphRAG от простого поиска — способность понимать сложные взаимосвязи между сущностями. Граф знаний представляет собой сеть узлов (растения, соединения, белки, гены, эффекты на здоровье) и связей между ними. При запросе система не просто извлекает документы, а проходит по путям графа, собирая релевантные фрагменты и собирая их в связный ответ. Это делает результат проверяемым и воспроизводимым, что критически важно для научной работы с требованиями регуляторов.

Решение BYOKG позволяет исследователям задавать вопросы на естественном языке и получать ответы с цитированием источников.

Architecture diagram showing data loaded into Amazon Neptune Analytics, with Amazon Bedrock and Amazon Comprehend Medical extracting data from medical journals
Architecture diagram showing data loaded into Amazon Neptune Analytics, with Amazon Bedrock and Amazon Comprehend Medical extracting data from medical journals · Источник: AWS Machine Learning Blog

Решение помогает сохранять институциональную память: даже если сотрудник уходит, его знания остаются зафиксированными в графе. Это снижает риск потери ценной информации и ускоряет ввод новых исследователей в курс дел. В перспективе такой подход может сократить время на генерацию гипотез и повысить долю успешных кандидатов на доклинических этапах.